为了解决用户在Windows 95中无法对注册表数据库等重要系统文件进行备份而导致的系统稳定性问题，Windows 98新增了一个注册表检查器，它能在每次启动时自动对注册表数据库进行检查，发现问题及时进行修复，并能在每天第一次启动时自动对当时的注册表数据库等系统文件进行备份，这样当系统出现问题之后我们只需利用它所作的备份即可恢复到备份时的状态(也是系统自动进行的)，从而极大的提高了系统的安全性。另外，用户也可手工启动注册表检查程序对注册表数据库进行备份，其步骤为：
1)单击'开始'按钮并选择'运行'命令，打开'运行'对话框。
2)在运行对话框中输入'SCANREGW'。
3)单击'确定'按钮，启动'系统注册表检查程序'。
4)此时，'系统注册表检查程序'会自动对注册表数据库进行检查，如果正确，它就会询问用户是否重新备份注册表数据库，如果有问题，它将建议用户采用上次备份的信息进行恢复，确保Windows 98正常运行。
注意，'系统注册表检查程序'并非仅仅只检查、备份Windows 98的注册表数据库，它同时也会处理WIN.INI和SYSTEM.INI文件。另外，它在备份文件时采用了压缩备份方式，即将所有的文件都压缩成一个CAB压缩包，然后再以RB???.CAB为名保存到Windows 98的SYSBCKUP目录中(???为CAB压缩包文件的序号)，这样既节省了磁盘空间，又提高了备份文件的安全性。
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