配置方面，iPhone6s搭载了一颗全新的苹果A9处理器，采用14nm制程工艺(暂不确定)，采用3核心架构，主频为1.85GHz，而GPU方面则为双核架构。
而三星Galaxy S6此次配备的是三星自家研发的Exynos 7420处理器，加以3GB LPDDR4内存，整体性能也排在旗舰机的前列。
系统方面，上搭载的当然是全新的iOS 9。最为重要的是iOS 9对3D Touch进行了适配，让触摸体验不仅限于UI平面。而三星Galaxy S6搭载的是Android 5.0系统。
摄像头作为iPhone6s硬件升级的一个重点，与前几代祖传的800万像素摄像头不同的是，iPhone6s搭载了一枚1200万像素摄像头，有力提高了相机的解析力，而像素经过重新构建，像素点之间的干扰信号更少(像是三星的ISOCELL技术)，更高效地利用光，让画面的噪点更低，色彩更通透。
而三星Galaxy S6采用的1600万主摄像头，配备了OIS(光学防抖)技术，并且能够实现快速拍照的功能，在0.7s的时间内实现拍照，此外摄像头还拥有实时HDR功能，能够根据场景实时开启HDR。而前置采用的是500万像素摄像头，拥有120广角，并且在软件上优化也做的很好，其前置拍摄效果足以超过苹果。
屏幕方面，iPhone6s搭载的是4.7寸屏幕，虽然iPhone6s与iPhone 6的屏幕在尺寸，分辨率以及材质方面改变不大，但关键是iPhone6s搭载了一块与Apple Watch相似的按压式触摸屏，从平面的触摸上升到了三维层次，但与Apple Watch不同的是iPhone6s的3D Touch压力触屏功能相对于在Apple Watch上的应用会更加广范和强悍。
而三星Galaxy S6采用康宁第四代大猩猩双面玻璃屏幕，搭配金属中框，整体外观和上代产品相比变化较大，仅6.8毫米厚，5.1英寸大小。屏幕是分辨率为2560x1600，577ppi的Super AMOLED显示屏，屏幕画质细腻逼真，色彩鲜艳。
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